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簡單來說各種微生物引起的感染症，都算是感染科醫師處理的範圍。感染症引起的疾病很多，包含熟知的COVID-19(新冠肺炎),登革熱,流感,甚至是腦炎、腦膜炎、肺炎、心內膜炎、膽道感染、肝膿瘍、泌尿道感染、腎臟膿瘍、蜂窩性組織炎、感染性脊椎炎、骨髓炎及不明熱等等。有上述任一個問題，都可以至感染科求診。

除了治療以上感染症外，感染科醫師在醫院中也擔負起抗生素合理使用及院內感染把關的重任，除了隨時掌握醫院微生物抗藥性外，也守護著民眾的健康。