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為南部最大、最完善的新生兒照護中心，為南部新生兒提供更好的醫療服務。
呼吸疾病是新生兒加護病房中最常見的問題。本院新生兒科配備有最完善的呼吸器，包括高頻呼吸器及吸入型一氧化氮，
甚至包括橫膈膜電位調整式呼吸器 (neurally adjusted ventilatory assist；NAVA)，已挽救許多過去無法存活的呼吸衰竭病嬰。

1. 團隊治療 (Team Therapy): 本院新生兒科加護病房的病嬰照顧採團隊治療 (Team Therapy)，即2至3位主治醫師為1個team，熟悉彼此之病例狀況，便於互相cover照顧病嬰，尤其是緊急狀況發生時，團隊治療可發揮加成效果。
2.南部最大新生兒中心 (The Largest Neonatal Center in Southern Taiwan): 重症加護單位共計新生兒加護病房30床，中重度病房35床。目前共有6位主治醫師。
3. 訓練有素的外接團隊 (Well-Trained Transport Team): 本院於民國88年11月率先於南部實施高危險新生兒外接作業，成立資深並具完整訓練之堅強外接醫護團隊，設立各項流程準則、護理指引、設備維護標準及監控作業，確保外接過程及後續照護之品質。服務對象為高高屏地區婦產科診所或區域醫院，經專科醫師評估後需轉介至醫學中心接受重症照護之早產兒及新生兒，適應症包括周產期窒息、呼吸窘迫、出生週數小於33週或出生體重小於1800公克之早產兒或持續性發紺、疑敗血症、明顯外科急症、休克及抽筋等。
4.各新生兒科主治醫師皆有其專攻之次專科:
鍾美勇醫師前往美國哥倫比亞大學附設 Mother and Baby‘s hospital 進修,專攻呼吸治療
黃新純醫師長庚大學臨床研究所博士,專攻免疫學
陳志誠醫師前往美國Huston大學Children‘s Nutrition Research Center at Baylor College of Medicine,專攻營養學
陳豐順醫師前往美國Harvard university & children’s Hospital,專攻缺氧性腦病變
5.新生兒科跨科際醫療：
　　 與各科有相當程度的跨科際醫療合作，如：
　 (1)婦產科：高危險妊娠新生兒之照會；高危險妊娠新生兒產房standby。
　 (2)眼科：早產兒視網膜病變（ROP）之檢查及追蹤治療。
　 (3)小兒外科：新生兒外科急症之處理。
　 (4)呼吸治療科：新生兒肺病之呼吸照護。
　 (5)其他兒童內科之次專科：重症加護病嬰之照顧。
　 (6)復健科：發育遲緩兒之復健。
　 (7)兒童心智科：發育遲緩兒之鑑定及心理評估。
　 (8)耳鼻喉科：早產兒聽力檢查及聽障兒治療。
　 (9)營養科：全靜脈營養及早產兒營養支持。
6.致力推廣母嬰親善及袋鼠護理：
　本院為母嬰親善認證醫院，強調母乳哺育之重要性。並在病人病況允許情況下，積極推廣袋鼠式照護。 袋鼠式照護對父母的助益，包括：
　(1)父母能寬心，對照顧早產兒較有信心，以減少罪惡感，建立早期的親子關係。
　(2)因與寶寶接觸可刺激分泌更多的母乳，增加哺乳成功率，進而使早產兒免疫力增加。
　(3)母親因為幫助寶寶較能處理她的早產兒出生的感受，讓父母渴望帶寶寶回家。
7.完善之呼吸器設備
鼻正壓呼吸 ( Nasal CPAP )
各式呼吸器,甚至包括橫膈膜電位調整式呼吸器 (neurally adjusted ventilatory assist；NAVA)
高頻呼吸器
一氧化氮 ( NO ) 治療