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嘉義長庚耳鼻喉頭頸外科自民國91年成立以來，積極提供雲嘉南地區民眾耳、鼻、喉、頭頸腫瘤各方面的診療。目前團隊共有十位主治醫師，其中兩位為醫學博士。本科研究動能在近幾年有顯著且持續地增長，至2022初，全科近五年共累積52篇國際級高品質論文（SCI）。此外，本科近幾年發展出多項特色醫療並有顯著成果。自2021年開始，本科升為系級，目前已經成為雲嘉南地區，耳鼻喉頭頸疾病的最主要治療中心。

耳科特色　
建立聽力障礙整體性之診斷、追蹤及聽能與語言復健之醫療網，包括：
人工電子耳植入術：目前已完成數十例電子耳手術，植入個案數為中彰雲嘉地區最多 。
微創耳膜修補手術：免住院局部麻醉修補耳膜手術，已完成兩百例以上；成功率可達八九成，與傳統手術相當，並已有論文發表

鼻科特色
使用導航定位及各式新型微絞刀片，使得手術更為安全。加上新式填塞的材料使用，大幅降低術後疼痛。與中醫合作的治療模式，更是未來本科的亮點。

喉科特色
擁有喉生理學及音聲檢查室；發展音聲醫學及喉功能性手術 ; 對於單側聲帶麻痹，聲帶萎縮及痙攣性失聲，目前音聲及吞嚥治療已成為本科特色之一。

頭頸部外科特色
使用窄頻影像系統篩檢早期頭頸癌及鼻咽癌，接受篩檢人數超過一萬人次。目前為雲嘉地區最重要頭頸癌治療中心，治療存活率已達到醫學中心水平，加上嘉義長庚院長領軍的整形外科，為頭頸癌病患重建顏面恢復功能，也有堅強的放射腫瘤及血液腫瘤科的團隊，大幅提升我們的治療效果，讓每位患者安心留嘉治療。