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嘉義長庚醫院於民國91年12月成立時即設立牙科門診治療區，初期規劃是以一般治療為主。目前有治療椅20檯，內含4個專屬獨立治療間，一為兒童牙科專用，二為口腔外科手術專用，另一為植牙手術專用。現有科主任一名、專任主治醫師8名、兼任主治醫師1名、兼任教學主治醫師1名(牙周病科)及PGY。除一般牙齒治療外，並各有次專科的專長，如牙周病科、根管治療科、矯正科、膺復科、口腔外科等，以服務需要的民眾及成為當地醫療院所的後送中心。為提高服務品質，除積極訓練住院醫師外，並獲台北、林口、高雄院區牙科部之支援，來充實科內人力，提昇治療及教學水準，以邁向次專科分科的建立。而看診方式除一般門診開放給初、複診病患掛號看診外，為使病患能獲得更完整和徹底的治療，經牙醫師與病患詳細討論病情後，依治療計劃採取約診方式進行治療。

嘉義牙科為充實人力，特別注重人才的培育。對於住院醫師的教學訓練有完備的訓練計劃。第一和第二年住院醫師，除了要求對各次專科的基礎訓練外，還要加強其一般牙科整合性治療觀念的建立。第三年以後的住院醫師則依其興趣與能力，予以次專科的訓練(必要時外送至其他院區)。並積極提供機會，讓住院醫師成為牙科次專科醫學會正式會員，並進一步取得專科醫師資格。
主治醫師除臨床教學外，亦有研究和提昇醫療品質的責任。因此，鼓勵主治醫師出國進修及定期參加國內外學術會議，以期吸收更多新技術和觀念，此外，本科從96年至今已發表超過20篇論文(含SCI paper12篇)，可以培養住院醫師研究學習的能力。