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本院小兒科秉承王董事長回饋鄉里，服務民眾的創院理念，自開始營運以來，一切皆以「病患」為中心，期望除了先進的醫療服務之外，還能與民眾、社區結合，提供涵蓋預防、保健及公共衛生等範疇的全方位醫療服務。目前由有13位小兒科主治醫師在嘉義院區服務，都為年輕、有活力、認真負責的醫師，次專科包括新生兒科、小兒胃腸肝膽科、小兒感染科、小兒神經科、兒童心臟科、兒童胸腔科、兒童急診及兒童過敏免疫風濕科、兒童血液腫瘤科、小兒內分泌科等。

目前兒童內科有一般病床、小兒加護病房、新生兒加護病房、中重度病房及嬰兒室共 72床

為了照顧較偏遠的兒童醫療保健，已多次參與醫院鄰近地區幼稚園或育幼院兒童的體檢及衛教。

除了服務病患與教學訓練之外，兒童內科也積極鼓勵論文發表，並參與研究工作。在住院醫師的晉升及主治醫師的考核，都將上述二項列為重點考核項目。以期兒童內科在服務、教學與研究各方面均能大步迎向未來的挑戰。