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台北長庚紀念醫院婦產科系於民國83年7月正式成立。在本科系下再細分為婦科、產科(優生保健科)及生殖內分泌科(不孕症科)。目前 長庚紀念醫院婦產部台北婦產科系主任是蕭勝文醫師，其下各分科主任分別是，產科主任陳彥廷醫師，生殖內分泌科主任尤星策醫師。
台北長庚紀念醫院婦產科系並成立生殖醫學中心和胎兒醫學中心，成為台北婦產科系的主軸及特色。

1.不孕症諮詢與各項檢查：懷孕能力評估與計畫、排卵功能、輸卵管、精液檢查、子宮內視鏡、腹腔鏡檢查與治療 。
2.人工生殖治療：人工授精、試管嬰兒、顯微授精、卵殼切開術、胚胎植入術。
3.女性卵巢功能評估：卵巢荷爾蒙檢查、超音波潛在卵泡計數、子宮頸黏液、排卵品質評估。
4.子宮或卵巢良性腫瘤：子宮內膜異位症、子宮肌腺症、不明原因痛經疾病、內分泌異常、卵巢囊腫、子宮肌瘤腹腔鏡手術、骨盆腔　都卜勒超音波檢查。
5.內視鏡手術：腹腔鏡手術、子宮鏡手術、超音波囊腫抽取術。