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1.薛宏昇,梁亞文,黃立凱,張良銘. 中醫專業人員之執業選擇及職業流動之研究. 中國醫藥科學雜誌, 2000 Jan;1(1):61~70.
2.薛宏昇,皮膚病理非感染性全身性水泡病診斷決策支援系統, (A Dermatopathological Diagnostic Decision Support System for Non-Infectious Generalized Blistering Diseases), 碩士論文, July,2000. 台北醫學院 醫學資訊研究所
3. Hsueh YM , Lin P, Chen HW, Shiue HS , Chung CJ , Tsai CT, Huang YK, Chiou HY , Chen CJ . Genetic polymorphisms of oxidative and antioxidant enzymes and arsenic-related hypertension. J Toxicol Environ Health A. 2005 Sep;68(17):1471-84.(SCI)
4. 張雅淳, 薛宏昇, 張恒鴻, 張晉賢, 楊岳隆, 顏宏融: 三伏天穴位貼敷對過敏性鼻炎之療效初探. 中醫藥雜誌, 第十七卷, 第一至二期, P. 15-24, 2006 (March-June)
研討會論文：
1. 薛宏昇 ,張正隆,張寶鈴,王順水,林安邦,吳昭新,蕭廣仁. 「健康諮詢網~中文醫學資訊在網際網路上實際運用的經驗」, MIST97 The First Medical Informatics Symposium in Taiwan. Taipei, Taiwan, November 1997.
2.曾淑芬, 薛宏昇 .「醫療諮詢網使用之滿意程度與使用傾向之研究」, Net'98 網路新紀元研討會,行政院NII推動小組, Taipei, Taiwan, March 1998.
3. Hongseng Shiue , Yu-Chuan Li. 「Web-Based Probabilistic Dermatopathological Diagnostic Decision Support System」. MIST98 The Second Medical Informatics Symposium in Taipei, Taiwan. November 1998.
4. Hongseng Shiue , Yu-Chuan Li, Da-Wei Wang.「Strategies in Security, Confidentiality and Privacy for Health Information Exchange」. MIST99 The Third Medical Informatics Symposium in Taiwan. Taipei, Taiwan, October 1999.
5. Liu HN , Li YC , Shiue HS , Chang YJ , Lin RY. 「A Dermatopathological Diagnostic Decision Support System for Non-Infectious Generalized Blistering Disease」. MIST99 The Third Medical Informatics Symposium in Taiwan. Taipei, Taiwan, October 1999.
6. HS Shiue , MF Sun, YC Li. Evidence-Based Medicine of Acupuncture on Migraine. The 6th International Academic Congress of Acupuncture and Moxibustion and Traditional Chinese medicine, Tianjin , China , from April 29 to May 1, 2000 .
7. Chang YJ , Shiue HS , Li YC , Liu HN. A web-based dermatopathological diagnostic decision support system for non-infectious generalized blistering diseases. In Proceedings of the American Academy of Dermatology 59th Annual Meeting. Washington D.C., United States, 2001.
8. Chang HH , Shiue HS , Lee YS, Chen CH, Chang YC : DNA microarray analysis in patients of allergic rhinitis treated with acupuncture. Symposium of the National Research Program for Genomic Medicine (VI). Chien Tan Overseas Youth Activity Center, Taiepi, Taiwan. February 27-28, 2005
9. 張恒鴻,薛宏昇, 李御賢 ,何正. 糖尿病陰虛症之基因體研究. 「中醫藥人才培訓II--中醫藥基因體研究及其核心技術訓練」培訓課程. 行政院PMRP中醫藥委員會九週年會慶系列活動，中國醫藥大學, 台中, 中華民國, 2004年11月20日
10.薛宏昇,張恒鴻, 李御賢 . 中醫辨證論治之基因體研究-以糖尿病陰虛證及針刺過敏性鼻炎為例. 中醫藥基因體研究及其核心技術訓練培訓課程, 行政院PMRP中醫藥委員會，高雄醫藥大學, 高雄, 中華民國, 2005年10月15日
11.薛宏昇, Acupuncture Pain control for lung cancer patients. 國際肺癌論壇：促進中西醫學合作研討會, 長庚紀念醫院, 林口, 中華民國, 2006年09月02日
技術報告及其他
1.薛宏昇 . 針刺治療偏頭痛的證據性探討. 中華針灸醫學會 南區學術研討會, 2000,05,21. 嘉義市天主教聖馬爾定醫院.
2.薛宏昇 . 介紹「傳染病鑑別診斷輔助系統」,「定點醫師」教育訓練課程，行政院衛生署疾病管制局主辦, 2002,06,02. 台東娜路灣酒店大禮堂.
3.薛宏昇 . 「傳染病鑑別診斷輔助系統」之簡介, 「新感染症症候群監視通報系統」研討會,主辦單位：行政院衛生署疾病管制局、中華民國感染症醫學會, 2002,06,29. 高雄醫學大學A2教室.
4.薛宏昇 . 「結核病的中醫保健」,「強身健康俱樂坊」第二次活動,基隆市衛生局主辦, 2003,08,29. 基隆市市議會5樓會議室
5.薛宏昇 ,張恒鴻, 李御賢 ,何正.「中醫科新進展~糖尿病陰虛症的基因體研究」，全院性學術活動，長庚紀念醫院基隆分院， 2004年7月23日 ，五樓國際會議廳。
6.張恒鴻 ,薛宏昇, 李御賢 ,何正. 糖尿病陰虛症之基因體研究. 「中醫藥人才培訓II--中醫藥基因體研究及其核心技術訓練」培訓課程. 行政院PMRP中醫藥委員會九週年會慶系列活動，中國醫藥大學, 台中, 中華民國, 2004年11月20日
7.薛宏昇 . 「臨床針灸治療程序」，中醫感染管控研討會， 2006年10月29日 ，桃園縣中醫師公會。
8.薛宏昇 . 「電針臨床標準作業規範」，台北區加強感控暨針灸標準作業研討會， 2006年12月10日 ，台北市中醫師公會。
9. 薛宏昇 . 「針灸過敏性鼻炎之探討」，台北縣中醫師公會2007年針傷醫學學術研討會， 2007年1月14日 ，台北縣中醫師公會，板橋。
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