兒科檢查區：
位於兒童醫院二樓，包含心臟超音波檢查室、腹部超音波檢查室、新生兒腦部超音波檢查室、腎臟超音波檢查室、心電圖室、腦波檢查室、腸胃道內視鏡檢查 室、血液腫瘤科檢查室、免疫及過敏原檢查室。
兒科門診區：
位於兒童醫院一樓，包含報到室、檢查室、注射室、 及各專科門診區。 非假日時每天都排定有各次專科門診，為兒科患者提 供全面性的諮詢與醫療
兒科血液腫瘤（6G）病房：
位於兒童醫院6樓，以6G為主要的病房區，內含兩間正壓隔離病房及6間正壓雙人病房，皆設置電視，以減少小病人長期住院時之不安與病痛。病房附設烹?室，以供兒癌病人家屬烹調之用。化學治療室鄰接6G病房，由6G專業護理人員負責，提供最安全舒適的門診化療環境。除此之外，最近並設立院內學校，提供血癌長期住院病患一個優良的上課環境，即使住院，亦不會耽誤學校功課。
兒科7F病房：
一、醫療團隊 ＊ 病房主任：刁茂盟 ＊ 護理長：楊佳榛 ＊ 本單位人力：:共25人 護理長：1人、副護理長：1人、護士：22人 、助理員: 2人。 二、病房特色 (一)床位數：共51床。 ＊特等房：2 間( 7F30、7F31)。 ＊頭等房： 5:間(7F:11、7F26、7F27、7F28、7F29)。 ＊二等房：11間( 7F01、7F02、7F03、7F17、7F18、7F19、 7F20、7F21、7F22、7F23、7F25) ＊三等房：6間( 7F05、7F06、7F12、7F13、7F15、7F16)。 ＊負壓隔離病房：4間 ( 7F07、7F08、7F09、7F10 ) (二)專科別：小兒科病房。
兒科7G病房：
l 病房區設置視聽室，設有圖畫書、VCD影片、電腦等設備，可減輕住院病童的不安與病痛。 l 病房區另設小遊戲室，牆面採泡棉牆壁，避免病童遊戲時撞傷，牆面為海洋圖案，可舒緩病童對醫院的恐懼。 l 每月定期舉辦與兒童疾病相關衛教及照護的團體衛教活動，並依衛教主題請呼吸治療師或營養師、藥師等參與，協助家屬如何照顧病童。 l 護理人員會妥善運用遊戲治療與病童互動，並提供貼紙等，適量獎勵品鼓勵病童。 l 每月召開醫護聯合討論會，針對有爭議的病例討論，並做成文書檔案，共同提昇病童和家屬的住院品質。 。
兒科加護病房：
位於兒童醫院六樓，唯一專業的兒童急救與加護單位，目前共有二十個床位，另外有新生兒加護病床 33 床。 編制有兒科專業護理師與兒科醫師，提供每天二十四 小時的加強照護。
新生兒加護病房：
本病房屬新生兒專科加護病房 ，目前服務的對象為早產兒及出生一個月內之新生兒 ，24 小時醫師駐診
新生兒中重度病房：
提供三個月以下病嬰照護與觀察，提供早產兒出院前準備及照護，提供新生兒家長照護的專業諮詢，24小時醫師駐診
嬰兒室：
主要照護對象為無疾病之新生兒，提供新生兒出院前準備及照護，提供新生兒照護的專業諮詢
